外泌体是一种包裹着膜的细胞外囊泡,其中包含了许多生物分子,包括蛋白质、RNA、DNA等。外泌体蛋白质是外泌体的主要组成部分之一,研究外泌体蛋白质组学有助于深入了解外泌体的功能和在疾病中的作用。外泌体蛋白质组学研究可以通过多种方法进行,其中包括质谱分析、免疫学检测等。外泌体蛋白质组学研究可以为研究人员提供许多信息,包括外泌体的生物合成、分泌、细胞信号传导、疾病发生发展等方面的信息。外泌体蛋白质组学技术服务项目通常包括外泌体的提取、蛋白质的分离、质谱分析等多个环节。通过这些环节,研究人员可以获得外泌体蛋白质的全面信息,进而对外泌体蛋白质进行分析和研究。
1. Label-free非标记定量蛋白质组
定量蛋白质组学是利用质谱平台检测样品中蛋白相对含量的分析化学技术,非标(Label free)蛋白质组定量技术是一种不依赖于同位素标记的蛋白质定量技术,该技术通过液质联用对蛋白质酶解肽段进行检测,分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,对被检测到的离子峰强度进行积分,以积分面积进行相对定量。
2. TMT标记定量蛋白质组
TMT (Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研发的一种多肽体外等重同位素标记的相对与绝对定量技术,采用6、10及16种同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,经高分辨质谱仪串联分析,可同时比较多达16种样品之间的蛋白质表达量,是定量蛋白质组学中的高通量筛选技术。
3. DIA定量蛋白质组
数据非依赖型采集模式(Data-Independent Acquisition,DIA)逐渐崭露头角。相较于DDA数据采集模式在一级质谱中每个时间窗口采集响应值较高的有限肽段离子(通常是TOP20)进入二级质谱进行碎裂分析。DIA将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂及检测,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。
4. PRM靶向蛋白组
平行反应监测(parallel Reaction Monitoring, PRM) 是一种基于Orbitrap为代表的高分辨、高精度质谱的离子监视技术,首先利用四级杆质量分析器的选择能力,用Q1选择目标肽段的母离子,随后在collision cell 中对母离子进行碎裂, 最后利用Orbitrap分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,即可对目标蛋白质/肽段进行相对(绝对)定量。从而实现对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。
5. 宏蛋白组
宏蛋白组学是应用蛋白质组学技术对微生物群落进行研究的一项新技术,在特定的时间对微生物群落的所有蛋白质的组成进行大规模的鉴定。宏蛋白组能够提供微生物在生态系统中的功能信息,它有望把微生物群落的遗传和功能多样性联系起来,对于不同环境的宏蛋白组分析可以捕捉新的功能基因和代谢途径、鉴定与特异性胁迫有关的蛋白,蛋白组学联合宏基因组学数据可以更好的揭示环境群落分类多样性、功能多样性和生物过程。
6. PBA单囊泡膜蛋白组
邻近编码技术(Proximity Barcoding Assay,PBA)使用微米大小的单链DNA簇,每个簇具有数百个通过滚环扩增产生特有的DNA拷贝序列,可对单个外泌体进行DNA编码标记。样本中单个外泌体的表面蛋白组成通过与之结合的抗体-DNA偶联物可被转化为DNA序列信息,该偶联物合并了每个滚环扩增产物中重复的随机编码序列。通过PCR扩增后,利用新一代测序技术解析DNA序列中包含的蛋白和外泌体信息,以识别单个外泌体的表面蛋白组成。邻近编码技术可高通量地编码标记样本中所有单外泌体表面蛋白,其检测限度取决于蛋白结合特异性、测序的范围和深度、以及抗体的亲和力和选择性。通过比较不同来源的外泌体图谱,可找到特定的表面蛋白组合作为生物标记物,用于识别和量化从健康和疾病的特定组织释放进入血液中的外泌体。
检测项目
服务序号 | 服务内容 | 服务说明 | 服务周期 |
1 | Label-free非标记定量蛋白质组 | 采用Label-free非标记定量方法进行蛋白组学检测并进行标准数据分析,交付:DOCX格式报告,RAW格式机器原始数据 | 20个工作日 |
2 | TMT标记定量蛋白质组 | 采用TMT标记定量方法进行蛋白组学检测并进行标准数据分析,交付:DOCX格式报告,RAW格式机器原始数据 | 20个工作日 |
3 | DIA定量蛋白质组 | 采用DIA定量方法进行蛋白组学检测并进行标准数据分析,交付:DOCX格式报告,RAW格式机器原始数据 | 20个工作日 |
4 | PRM靶向蛋白组 | 采用PRM靶向定量方法进行蛋白组学检测并进行标准数据分析,交付:DOCX格式报告,RAW格式机器原始数据 | 20个工作日 |
5 | 宏蛋白组 | 采用宏蛋白组方法进行蛋白组学检测并进行标准数据分析,交付:DOCX格式报告,RAW格式机器原始数据 | 30个工作日 |
6 | PBA单囊泡膜蛋白组 | 采用PBA单囊泡膜蛋白组进行膜蛋白组学检测并进行标准数据分析,交付:PDF格式报告,FASTQ机器原始数据 | 30个工作日 |
微环DNA表达双靶向抗体的癌症免疫治疗技术成为继CAR-T技术(“嵌合抗原受体T细胞免疫疗法”)、TIL技术(“肿瘤渗润淋巴细胞技术)、免疫检查点抑制剂等技术之后又一项获得成功的新一代治疗技术。