微生物组学

       微生物组学研究常用的检测方法主要包括扩增子（16S/ITS/18S）测序和宏基因组测序，16S测序技术主要用来检测微环境中细菌的种类和丰度，但是这种方法灵敏度不够高，仅能在属水平进行准确鉴定，所获得结果无法进一步揭示菌群在代谢和功能分类上的具体作用，寻求“种”水平分辨率鉴定已经成为各个研究领域的迫切需求。尽管宏基因组测序技术可以达到种水平分辨率，但测序和计算成本都很高，限制了大规模研究。为此，一个以色列团队开发了16S多区域测序技术（SMURF/5R）。这是一个基于多重PCR技术，涵盖了16S高变区中的5个，可达到“种”水平的鉴定分辨率。5R 16S测序与常规扩增策略相比，此方法扩增出的区域覆盖约68%的16S全长序列，可以大幅提高细菌物种检测的覆盖率和分辨率，已经在CELL、Science及Nature Communication等30多篇国际权威杂志上采用。