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植物外泌体组学分析指南

作者:admin   添加时间:2026-08-12 16:15:27   浏览:

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引言:组学分析能回答什么?

外泌体分离鉴定只是第一步——真正回答"这批外泌体里有什么、携带什么信息、可能发挥什么功能",靠的是组学分析

植物外泌体(植物来源细胞外囊泡)的组学研究近年快速增长:转录组揭示其携带的 miRNA/lncRNA 调控网络,蛋白组解析功能蛋白构成,代谢组定位小分子活性成分。三类组学互为补充,适用于不同科学问题。本文按"选型思路 → 方法对比 → 送样要求 → 结果交付"给出完整指南。

一、三步确定组学方案

第 1 步:明确科学问题

你想回答的问题推荐组学
外泌体里有哪些 miRNA/lncRNA?是否靶向特定通路?转录组(miRNA / LncRNA)
外泌体表面/内部有哪些功能蛋白?蛋白组(DIA)
外泌体携带哪些小分子活性成分(糖/氨基酸/黄酮/酚类)?代谢组(LC-MS/MS)
外泌体膜上有哪些脂类成分?脂质组(LC-MS)
外泌体是否含微生物来源核酸?微生物组(Nanopore 16S)

第 2 步:确认样本量是否达标(见下文送样指南)

第 3 步:确定是否要"多组学联合"——多组学整合(如转录+蛋白)可从分子不同层面交叉验证,适合深度机制研究。

二、核心组学方法对比

组学方法/平台参考价格周期推荐送样量
miRNA 测序Qiaseq 建库 + illumina 测序(10M reads / 3G RAW)1000 元/样20 个工作日RNA 10ng(最低 1ng)
LncRNA 测序Smartseq 建库 + illumina(10G RAW,LncRNA+mRNA 标准分析)1000 元/样20 个工作日RNA 10ng(最低 1ng)
蛋白组DIA 技术,Thermo Astral 平台1000 元/样20 个工作日蛋白/外泌体 10μg
代谢组非靶代谢 LC-MS/MS,QE / HF-X 平台300 元/样20 个工作日蛋白/外泌体 10μg
植物代谢组非靶代谢 LC-MS/MS(覆盖糖类、氨基酸、核苷酸、生物碱、黄酮类、酚类等)500 元/样20 个工作日蛋白/外泌体 10μg
脂质组脂质组学相对定量 LC-MS/MS,QE / HF-X 平台600 元/样20 个工作日蛋白/外泌体 10μg

植物样本特别提醒

三、送样指南

组学送样类型推荐量最低量保存
转录组(miRNA/LncRNA)外泌体 RNA10ng1ng-80℃,干冰运输
蛋白组(DIA)外泌体/蛋白10μg-80℃
代谢组/脂质组外泌体/蛋白10μg-80℃
微生物组(16S)外泌体 DNA50μg(或 DNA 20ng)-80℃
基因组(WGS)外泌体 DNA50μg(或 DNA 20ng)-80℃
送样前建议先做基础鉴定(粒径/浓度/标志蛋白)确认样本质量;若提供外泌体样本,需先进行 RNA 提取和毛细管电泳质控(200 元/样,2 个工作日)。

四、结果交付物

常见问题(FAQ)

Q1:我只有少量珍贵样本,能做组学吗?

A:可以。转录组最低 RNA 用量 1ng;微量样本建议先用磁珠捕获或者超声纳滤富集,再做组学。

Q2:转录组、蛋白组、代谢组能否联合分析?

A:可以。多组学联合可从不同分子层面交叉验证,适合深度机制研究,建议送样时同步确认分析需求。

Q3:植物外泌体和动物外泌体组学有什么不同?

A:可按照目标物种的参考基因组和注释文件,并结合目标物种转录组、近缘物种基因组或从头组装结果构建分析基础。若缺少高质量参考资源,应在报告中明确数据来源、替代策略和结论边界,不宜将同源预测结果表述为已验证功能。

Q4:组学分析多久出结果?

A:常规转录组/蛋白组/代谢组约 20 个工作日;交付含原始数据与标准分析报告。

Q5:测序平台可以指定吗?

A:转录组默认 illumina 平台,蛋白组默认 Thermo Astral,代谢组默认 QE/HF-X;如有个性化平台或深度需求,可单独咨询报价。

为什么选择生命互联?

需要先做分离鉴定再送组学?参见植物外泌体分离鉴定全流程指南;完整项目价格与周期见收费明细;直接委托请访问组学分析服务页

最后更新:2026-08-12

*本文由厦门生命互联科技整理,参考价格与周期以收费明细为准,具体以双方合同约定为准。*

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